是羊驼肾细胞培养中*主要的污染类型，来源包括：
细菌：主要来自操作环境空气、未彻底灭菌的耗材试剂、操作人员手部皮肤，污染后会导致培养基浑浊、细胞快速崩解死亡。
真菌：多由操作人员带入（孢子容易随空气传播），常见于培养箱水盘长期未换水滋生，污染后可见培养液中出现肉眼可见的漂浮物，显微镜下可见菌丝。
支原体：属于隐蔽性污染，来源包括引进的细胞系本身带支原体、污染的血清或耗材，常规显微镜观察无法发现，会缓慢降低细胞活力、改变基因表达，是*棘手的生物污染之一。
病毒：主要来源于原代分离的羊驼肾组织本身，或被病毒污染的血清，会影响细胞状态，带来实验安全风险。
2. 细胞交叉污染
多为操作不当导致，即其他细胞系混入羊驼肾细胞培养体系中，常见来源包括：同时操作多株不同细胞时共用耗材/培养基、不同细胞分瓶时操作间隔过近，会导致羊驼肾细胞被其他细胞替代，改变原有细胞遗传背景，得到错误的实验结果。
3. 物理化学污染
这类污染来自环境中的非生物杂质，具体来源包括：
培养耗材残留的清洁剂、消毒剂、重金属离子；
培养基配制用水不合格（杂质未去除）；
血清中沉淀杂质或储存过程产生的降解产物；
培养箱温度/CO₂浓度失控，也会被归为广义的物理环境污染。
