1. 提取溶液组分调整

     提取溶液组分调整，是基于DNA和RNA的特性来完成的，*常见的是类似于Trizol的方法（比如全式金的TransZol Up等，宣称可以一定程度上去除DNA污染，应该就是这个原理），调整溶液的pH，使得DNA在分层后的中间层，RNA在上层的水相，这样吸走RNA的时候，如果不触及中间层，则绝大部分的DNA都会留在中间层，RNA中DNA的含量就会很少，提取的效果就像上面图片中的泳道2-3的效果，几乎看不到基因组DNA的污染。

    有一点需要注意的是，这种类型的试剂对于样本的pH或影响pH较多的样本，在提取后是有可能变成泳道5中的情况的。之前遇到过有人提取菌液的RNA，怎么提都有DNA污染，建议离心后直接用试剂去裂解，就几乎没有了，也就是说菌的重悬Buffer中的pH异常，导致类似于Trizol试剂提取时pH异常，*终导致RNA和DNA区分不开。

2. 提取过程中加入DNase来去除DNA

    提取过程中去除DNA，多见于使用柱提法来完成RNA提取的试剂盒，这种试剂盒前期一般会有一些样本裂解的过程，在样本裂解后，一般会上有硅基质的柱子来吸附里面的核酸（比如天根的DP441就是这个类型的），柱子本身可以吸附DNA和RNA，只想保留RNA的话，一般会加入DNase到柱子上去消化掉其中的DNA。由于裂解液的残留会一定程度上抑制DNase的活性，所以我们可以看到，加入到柱子上消化的DNase的量会远大于我们常规对于提取后的RNA消化时的用量，这是为了以大量的DNase来抵消活性被抑制导致消化不足，有DNA残留的情况出现。

  基于之前提到的原因，少量的裂解液和其它的污染物，可能会对DNase活性有抑制，所以这种情况下，可能会有痕量的DNA残留，这个级别的DNA残留大多数情况下并不会明显影响后续的实验，如PCR或qPCR等。但是如果对DNA污染要求非常严格，还是要注意一下这种情况。

3. 用不同的吸附柱去除DNA--基因组DNA去除柱

     基因组DNA去除柱主要是利用基因组DNA与RNA的结构差异，同时利用吸附介质的特异性来区分和结合基因组DNA，从而达到基因组DNA去除的目的。大体的原理是利用DNA（双链）和RNA（单链），在不同缓冲条件和介质下吸附能力的不同，基因组DNA去除柱利用这一结构差异，通过专门设计的吸附介质和缓冲体系，选择性地结合并清除样品中的基因组DNA，而不会影响RNA的质量。

     从原理上可以看出，如果DNA有断裂，或者有解链，也是会有微量的DNA不会被吸附，*终到RNA里面去的。基因组DNA去除柱，可以去除绝大部分的基因组DNA，而且在样本量较少的时候效果比较好，比如，少于100W个细胞，低于20 mg的组织样本等；当样本量变大时，去除基因组DNA的效果就会明显的下降。

  所以我们在选择这种方法去除基因组DNA污染时，要考虑好适用的范围。