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PCR程序设置与运行

点击次数:14次     发布时间:2025/5/14 14:09:08

 实验操作过程:
 
一、E.coli DNA 定量参考品的稀释及标准曲线的制备
 
用试剂盒中提供的 DNA dilution buffer 将 E.coli Control DNA 进行梯度稀释,稀释浓度依 次为 300pg/μl 、30pg/μl 、3pg/μl 、300fg/μl 、30fg/μl。具体操作如下:
 
1.将试剂盒中的 E.coli Control DNA 和 DNA dilution buffer 置于冰上融化,待完全融化后, 轻微振荡混匀,简短快速离心。
 
2.取 5 支干净的 1.5ml 离心管,分别标记为 SD1 ,SD2 ,SD3 ,SD4 ,SD5。
 
3,SD1 管中加入 198μl DNA dilution buffer,其余管中分别加入 180μl DNA dilution buffer。
 
4,取 2μl  E.coli control  DNA 加入 SD1 管中, 然后涡旋振荡混匀 5-10s 后短时快速离心 5s,涡旋振荡和快速离心各重复 3 次。
 
5,按表 2 依次进行 5 次梯度稀释操作,稀释操作同步骤 4。

二、PCR反应体系的配制及加样
 
1. 取出预混的qPCR Master Mix(含荧光染料和DNA聚合酶),室温避光静置10分钟使其完全溶解,短暂离心后备用。
2. 在冰上按表3配制反应体系(总体积20μl/孔):
- 10μl 2× qPCR Master Mix
- 2μl Primer Mix(上下游引物终浓度均为0.5μM)
- 2μl 梯度稀释的标准品或待测样本
- 6μl Nuclease-free Water
3. 将混合液轻轻吹吸混匀8-10次,避免产生气泡,短暂离心后分装至八联管中,每孔18μl。
 
 
1. 将八联管置于定量PCR仪中,设置以下扩增程序:
- 预变性:95℃ 3分钟
- 循环阶段(40个循环):95℃ 15秒 → 60℃ 30秒(荧光信号采集)
- 熔解曲线分析:60℃至95℃,每0.5℃升温5秒
2. 运行结束后检查扩增曲线和熔解曲线,标准曲线要求R²≥0.99,扩增效率在90%-110%之间。
 
四、数据分析
 
1. 仪器软件自动生成Ct值与浓度对数的标准曲线,根据待测样本Ct值计算初始DNA浓度。
2. 若样本出现非特异性扩增(熔解曲线多峰),需重新优化引物或模板纯度。
 
(注意事项:所有操作需在超净台中进行,避免气溶胶污染;每次梯度稀释需更换无菌枪头。)

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