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产品名称 | 英文名称 | 规格 | 货号 |
固定组织基因组DNA提取试剂盒 | FFPE DNA Extraction Kit | 50次 | CS-01F99063 |
本试剂盒适用于从福尔马林固定、石蜡包埋的组织中有效纯化总DNA,包括基因组DNA和线粒体DNA。本品使用专门优化的裂解液和蛋白酶K,释放福尔马林固定或组织切片样本中的DNA,无需过夜操作;消化后的样品在较高的温度孵育后,去除由福尔马林交联造成的抑制作用,有效提高DNA的产量和纯度;优化的缓冲系统使裂解液中的DNA可特异结合到硅胶吸附膜上,而其他污染物可流过膜;PCR和酶反应的抑制剂以及残留的杂质可通过两步漂洗步骤有效去除,最后使用低盐缓冲液或水洗脱,即可获得高纯度DNA。经过纯化的DNA可以直接用于PCR、Real-time PCR、SNP基因分型、STR基因分型和药物基因组学研究等。
自备试剂:无水乙醇、10mM PBS(PH7.4)(固定液中的组织)。
实验前准备及重要注意事项: 1、向蛋白酶K 中加入1.25ml 蛋白酶K 储存液使其溶解,-20℃保存。配制好的蛋白酶K 勿长时间室温放置,避免反复冻融,以免影响其活性。 2、获得样品后,要尽快将样品在4%-10%的福尔马林中固定,固定时间以14-24小时为宜,时间过长易导致基因组断裂,影响下游实验。 3、确保包埋前的样品彻底脱水,残留的福尔马林会抑制蛋白酶K 的作用。 4、第一次使用前应按试剂瓶标签说明先在Buffer GW1和Buffer GW2中加入无水乙醇。 5、使用前请检查Buffer GTL和Buffer GL是否出现结晶或者沉淀,如有结晶或者沉淀,请将Buffer GL和Buffer GTL于56℃水浴重新溶解。 6、如果下游实验对RNA污染比较敏感,可以在加入Buffer GL前加入4μl DNase-Free的RNase A(100 mg/ml),RNase A本试剂盒并未提供,如果需要可单独向本公司订购,货号:WE0225S。 操作步骤: 1、样本处理: a. 石蜡包埋样本:用手术刀将组织块中多余的石蜡修剪掉,露出组织。 b. 福尔马林等固定液中的样本:取约20 mg的样本,切成小块,置于离心管中,加入500μl 10mM PBS(PH7.4),涡旋振荡,12000rpm(~~13400×g)离心1分钟,重复3次,可直接进行第7步操作。 2、将组织块切成5-10μM的薄片。 注意:如果样品表面已经暴露在空气中,请将接触空气的2-3片弃掉不用。 3、取约1×1cm2的切片(共约4-5片切片)置于离心管(自备)中,加入1ml二甲苯,盖紧管盖,涡旋震荡10秒。 4、12000rpm离心2分钟,小心吸弃上清,注意不要吸弃沉淀。 5、加入1ml无水乙醇,涡旋震荡混匀。12000rpm离心2分钟,弃上清,注意不要吸弃沉淀。 注意:乙醇可以除去样品中残余的二甲苯。 6、打开管盖,室温或最高至37℃孵育10分钟,直至无乙醇残留。 7、加入180μl Buffer GTL,重悬沉淀;加入20μl 蛋白酶K ,涡旋震荡混匀。 8、56℃孵育1小时,直至样品完全溶解。90℃孵育1小时。短暂离心,使管壁上的溶液收集到管底。 注意: 1)此步骤的目的是修复由甲醛变性的核酸,孵育的温度过高或时间过长可能造成DNA断裂,产生DNA碎片。 2)56℃孵育后的样品可置于室温,直至水浴锅或干浴锅温度达到90℃后再把样品置于90℃孵育。 3)如需除去RNA,可将样品温度降到室温后,加入4μl浓度为100 mg/ml 的RNase A溶液,震荡混匀,室温放置5-10分钟。 9、加入200μl Buffer GL,涡旋震荡彻底混匀。加入200μl无水乙醇,涡旋震荡彻底混匀。短暂离心,使管壁上的溶液收集到管底。 注意: 1)加入Buffer GL和无水乙醇后要立即充分混匀。 2)如果需要对多个样品进行操作,可以将Buffer GL和无水乙醇事先混匀后加样。 10、将步骤9所得溶液全部加入已装入收集管的吸附柱中,若一次不能加完溶液,可分多次转入。12000rpm离心1分钟,倒掉收集管中的废液,将吸附柱重新放回收集管中。 11、向吸附柱中加入500μl Buffer GW1(使用前检查是否已加入无水乙醇),12000rpm离心1分钟,倒掉收集管中的废液,将吸附柱重新放回收集管中。 12、向吸附柱中加入500μl Buffer GW2(使用前检查是否已加入无水乙醇),12000rpm离心1分钟,倒掉收集管中的废液,将吸附柱重新放回收集管中。 13、12000rpm离心2分钟,倒掉收集管中废液。将吸附柱置于室温数分钟以彻底晾干。 注意:这一步目的是将吸附柱中残余乙醇去除,乙醇残留会影响后续酶促反应(酶切、PCR等)。 14、将吸附柱置于一个新的离心管(自备)中,向吸附柱的中间部位悬空加入20-100μl Buffer GE或灭菌水,室温放置2-5分钟,12000rpm离心1分钟,收集DNA溶液,-20℃保存DNA。 注意: 1)如果下游实验对pH值或EDTA敏感,可以用灭菌水洗脱。洗脱液的pH值对洗脱效率有很大影响,若用水做洗脱液应保证其pH值在7.0-8.5(可以用NaOH将水的pH值调到此范围),pH值低于7.0时洗脱效率不高。 2)离心之前室温孵育5分钟可以增加产量。 3)用另外的20-100μl Buffer GE或灭菌水再次洗脱可以增加产量。 4)如果要提高DNA的终浓度,可以将步骤14所得的DNA洗脱液重新加至吸附膜上,重复步骤14;若洗脱体积小于100μl,可以增加DNA的终浓度,但可能会减少总产量。如果DNA的量小于1μg,推荐用20μl Buffer GE或灭菌水洗脱。 5)因为保存在水中的DNA会受到酸性水解作用的影响,如需长期保存,推荐用Buffer GE洗脱并于-20℃保存。储存条件:室温(15~30℃)。 |
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