上海莼试生物技术有限公司
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产品名称:
固定组织基因组DNA提取试剂盒
型号:
CS-01F99063
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国产
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产品简介
固定组织基因组DNA提取试剂盒现货供应,价格实惠。
产品详情

一、概述:

 产品属性: 

产品名称

英文名称

规格

货号

固定组织基因组DNA提取试剂盒

FFPE DNA Extraction Kit

50

CS-01F99063

 

本试剂盒适用于从福尔马林固定、石蜡包埋的组织中有效纯化总DNA,包括基因组DNA和线粒体DNA。本品使用专门优化的裂解液和蛋白酶K,释放福尔马林固定或组织切片样本中的DNA,无需过夜操作;消化后的样品在较高的温度孵育后,去除由福尔马林交联造成的抑制作用,有效提高DNA的产量和纯度;优化的缓冲系统使裂解液中的DNA可特异结合到硅胶吸附膜上,而其他污染物可流过膜;PCR和酶反应的抑制剂以及残留的杂质可通过两步漂洗步骤有效去除,最后使用低盐缓冲液或水洗脱,即可获得高纯度DNA。经过纯化的DNA可以直接用于PCRReal-time PCRSNP基因分型、STR基因分型和药物基因组学研究等。

自备试剂:无水乙醇、10mM PBS(PH7.4)(固定液中的组织)

实验前准备及重要注意事项:

1、向蛋白酶K 中加入1.25ml 蛋白酶K 储存液使其溶解,-20℃保存。配制好的蛋白酶K 勿长时间室温放置,避免反复冻融,以免影响其活性。

2、获得样品后,要尽快将样品在4%-10%的福尔马林中固定,固定时间以14-24小时为宜,时间过长易导致基因组断裂,影响下游实验。

3、确保包埋前的样品彻底脱水,残留的福尔马林会抑制蛋白酶K 的作用。

4、第一次使用前应按试剂瓶标签说明先在Buffer GW1Buffer GW2中加入无水乙醇。

5、使用前请检查Buffer GTLBuffer GL是否出现结晶或者沉淀,如有结晶或者沉淀,请将Buffer GLBuffer GTL56℃水浴重新溶解。

6、如果下游实验对RNA污染比较敏感,可以在加入Buffer GL前加入4μl DNase-FreeRNase A(100 mg/ml)RNase A本试剂盒并未提供,如果需要可单独向本公司订购,货号:WE0225S

操作步骤:

1、样本处理:

a. 石蜡包埋样本:用手术刀将组织块中多余的石蜡修剪掉,露出组织。

b. 福尔马林等固定液中的样本:取约20 mg的样本,切成小块,置于离心管中,加入500μl 10mM PBS(PH7.4),涡旋振荡,12000rpm(~~13400×g)离心1分钟,重复3次,可直接进行第7步操作。

2、将组织块切成5-10μM的薄片。

注意:如果样品表面已经暴露在空气中,请将接触空气的2-3片弃掉不用。

3、取约1×1cm2的切片(共约4-5片切片)置于离心管(自备)中,加入1ml二甲苯,盖紧管盖,涡旋震荡10秒。

412000rpm离心2分钟,小心吸弃上清,注意不要吸弃沉淀。

5、加入1ml无水乙醇,涡旋震荡混匀。12000rpm离心2分钟,弃上清,注意不要吸弃沉淀。

注意:乙醇可以除去样品中残余的二甲苯。

6、打开管盖,室温或最高至37℃孵育10分钟,直至无乙醇残留。

7、加入180μl Buffer GTL,重悬沉淀;加入20μl 蛋白酶K ,涡旋震荡混匀。

856℃孵育1小时,直至样品完全溶解。90℃孵育1小时。短暂离心,使管壁上的溶液收集到管底。

注意:

1)此步骤的目的是修复由甲醛变性的核酸,孵育的温度过高或时间过长可能造成DNA断裂,产生DNA碎片。

2)56℃孵育后的样品可置于室温,直至水浴锅或干浴锅温度达到90℃后再把样品置于90℃孵育。

3)如需除去RNA,可将样品温度降到室温后,加入4μl浓度为100 mg/ml RNase A溶液,震荡混匀,室温放置5-10分钟。

9、加入200μl Buffer GL,涡旋震荡彻底混匀。加入200μl无水乙醇,涡旋震荡彻底混匀。短暂离心,使管壁上的溶液收集到管底。

注意:

1)加入Buffer GL和无水乙醇后要立即充分混匀。

2)如果需要对多个样品进行操作,可以将Buffer GL和无水乙醇事先混匀后加样。

10、将步骤9所得溶液全部加入已装入收集管的吸附柱中,若一次不能加完溶液,可分多次转入。12000rpm离心1分钟,倒掉收集管中的废液,将吸附柱重新放回收集管中。

11、向吸附柱中加入500μl Buffer GW1(使用前检查是否已加入无水乙醇)12000rpm离心1分钟,倒掉收集管中的废液,将吸附柱重新放回收集管中。

12、向吸附柱中加入500μl Buffer GW2(使用前检查是否已加入无水乙醇)12000rpm离心1分钟,倒掉收集管中的废液,将吸附柱重新放回收集管中。

1312000rpm离心2分钟,倒掉收集管中废液。将吸附柱置于室温数分钟以彻底晾干。

注意:这一步目的是将吸附柱中残余乙醇去除,乙醇残留会影响后续酶促反应(酶切、PCR)

14、将吸附柱置于一个新的离心管(自备)中,向吸附柱的中间部位悬空加入20-100μl Buffer GE或灭菌水,室温放置2-5分钟,12000rpm离心1分钟,收集DNA溶液,-20℃保存DNA

注意:

1)如果下游实验对pH值或EDTA敏感,可以用灭菌水洗脱。洗脱液的pH值对洗脱效率有很大影响,若用水做洗脱液应保证其pH值在7.0-8.5(可以用NaOH将水的pH值调到此范围)pH值低于7.0时洗脱效率不高。

2)离心之前室温孵育5分钟可以增加产量。

3)用另外的20-100μl Buffer GE或灭菌水再次洗脱可以增加产量。

4)如果要提高DNA的终浓度,可以将步骤14所得的DNA洗脱液重新加至吸附膜上,重复步骤14;若洗脱体积小于100μl,可以增加DNA的终浓度,但可能会减少总产量。如果DNA的量小于1μg,推荐用20μl Buffer GE或灭菌水洗脱。

5)因为保存在水中的DNA会受到酸性水解作用的影响,如需长期保存,推荐用Buffer GE洗脱并于-20℃保存。储存条件:室温(1530)

实验步骤:
(1)实验开始前将RNA提取液于65℃水浴锅中预热,离心管中加入ME(巯基乙醇),(10mL加80ul,50mL中加入300ul)
(2)取约0.8g菌丝体(液体培养获得的菌丝用真空抽滤即可!固体培养就更好说了),在液氮中迅速磨成精细粉末,装入50mL离心管,按1g材料8mL的量加入预热的RNA提取液,颠倒混匀  
(3)65℃水浴3-10 min,期间混匀2-3次
(4)加入等体积的酚(注意是酸酚pH4.5)::异戊醇(25:24:1)抽提(10,000rpm,4℃,5 min)
(5)取上清,等体积的:异戊醇(24:1)抽提(10,000rpm,4℃,5 min)
(6)加入1/4V体积10M LiCl溶液,4℃放置6h以上(或过夜)
(7)10,000rpm,4℃离心20min
(8)弃上清,用500ul SSTE溶解沉淀
(9)酚::异戊醇(25:24:1)抽提两次,:异戊醇(24:1)抽提1次(10,000rpm,4℃,5min)
(10)加2V体积的无水乙醇,在-70℃冰箱沉淀30min以上
(11)12,000rpm,4℃离心20 min
(12)弃上清.沉淀用70%酒精漂洗一次,干燥
(13)加200ul的DEPC处理水溶解
(14)用非变性琼脂糖凝胶电泳和紫外分光光度计扫描检测RNA的质量
(在抽提过程中,若蛋白质含量或其它的杂质还较多,可以增加抽提次数)
操作步骤:
1. 匀浆处理:a.组织 将组织在液氮中磨碎,每50-100mg组织加入1ml TRIzol,用匀浆仪进行匀浆处理。样品体积不应超过TRIzol体积10℅。
b.单层培养细胞 直接在培养板中加入TRIzol裂解细胞,每10cm2面积(即3.5cm直径的培养板)加1ml,用移液器吸打几次。TRIzol的用量应根据培养板面积而定,不取决于细胞数。TRIzol加量不足可能导致提取的RNA有DNA污染。
c.细胞悬液 离心收集细胞,每5-10×106动物、植物、酵母细胞或1×107细菌细胞加入1ml TRIzol,反复吸打。加TRIzol之前不要洗涤细胞以免mRNA降解。一些酵母和细菌细胞需用匀浆仪处理。产品仅用于科研
2.将匀浆样品在室温(15-30℃)放置5分钟,使核酸蛋白复合物完全分离。
3.可选步骤:如样品中含有较多蛋白质,脂肪,多糖或胞外物质(肌肉,植物结节部分等)可于2-8℃10000×g离心10分钟,取上清。离心得到的沉淀中包括细胞外膜,多糖,高分子量DNA,上清中含有RNA。处理脂肪组织时,上层有大量油脂应去除。取澄清的匀浆液进行下一步操作。
5. 每使用1ml TRIzol加入0.2ml,剧烈振荡15秒,室温放置3分钟。
6. 2-8℃10000×g离心15分钟。样品分为三层:底层为黄色有机相,上层为无色水相和一个中间层。RNA主要在水相中,水相体积约为所用TRIzol试剂的60℅。
7. 把水相转移到新管中,如要分离DNA和蛋白质可保留有机相,进一步操作见后。用异丙醇沉淀水相中的RNA。每使用1ml TRIzol加入0.5ml异丙醇,室温放置10分钟。
8. 2-8℃10000×g离心10分钟,离心前看不出RNA沉淀,离心后在管侧和管底出现胶状沉淀。移去上清。

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