注意事项：

流速是一个影响GST标签蛋白或其他结合蛋白连接到GST树脂的重要因素。保持流速降低有利于重组蛋白大程度的连到树脂上。此外蛋白质本身的性质，pH和温度等因素也可能影响结合能力。

洗脱时使用液体的体积和次数根据蛋白的性质而决定。在洗脱时根据需要加入更高浓度的。如有必要可对流穿、清洗和洗脱液进行SDS-PAGE并结合Western Blot确定纯化GST标签蛋白的效果。

GST检验步骤可以用于洗脱时的优化或跟踪GST标签蛋白的纯化。

通过测量在280nm处的吸光度可以估算GST标记蛋白的浓度。GST标签可以使用转换近似，A280≈1对应≈0.5mg/ml。

GST标签蛋白的浓度也可以通过标准显色法测定（如：Lowry法、BCA法和Bradford法）。如果使用Lowry法或BCA法检测，样品必须先用脱盐柱或将样品透析到PBS以去除，它可以干扰蛋白质的测定。改良型Bradford法和普通型Bradford法及改良型BCA法或非干扰蛋白浓度测定试剂盒可直接用于定量，无需去除。

GST树脂的重复使用取决于样品的天然状态以及纯化相同的样品（防止交叉污染）。
如果GST树脂几乎已经失去结合能力，这可能是由于沉淀物的堆积、变性或非特异性结合的蛋白质导致的。