MQAE 的工作液可以配制于Krebs-HEPES 缓冲液中。Krebs-HEPES 缓冲液即为20mM HEPES，128mM NaCl，2.5mM KCl，2.7mMCaCl2，1mM MgCl2，16mM glucose，pH7.4。MQAE 标记细胞时的浓度通常为5-10mM。以约800-1000 万细胞每毫升的细胞密度，在含有5-10mM MQAE 的Krebs-HEPES 缓冲液中孵育30-60 分钟。通常一个探针的装载体系为100 微升即可。随后用Krebs-HEPES缓冲液或其它适当溶液洗涤5 次左右，即可进行相应荧光测定。详细的使用方法请参考相关文献。以下对胞内氯离子的荧光测量[Cl-]做简要说明计算。Stem-Volmer 方程可以给出氯离子探针的荧光度与氯离子浓度的关系：

(FO/F) – 1 = KSV[Q]

FO 是没有卤化物或其他淬灭离子时的荧光度，F 是有淬灭剂时的荧光度，[Q]是淬灭剂浓度，而KSV 是Stem-Volmer 方程常数。建议对实验体系进行校准，以得到研究用细胞类型的指示剂探针的Ksv，利用线性回归模型分析Stem-Volmer 方程。Stem-Volmer 方程中的氯离子Ksv 常数可以随着碰撞淬灭的阴离子物质的增多而明显降低，如多肽。便于校准，可以固定胞内氯离子的浓度，通过使用双三丁基氧化锡和尼日利亚菌素10~30μM。为了保证渗透压好使用阴离子不淬灭染料，取代氯离子，如葡萄糖酸。
储存：-20℃，避光，有效期6个月。