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钠离子荧光探针 | SBFI, AM | 1mg | CS-01F96970 |
Na+敏感型染料,SBFI 和K+敏感型染料,PBFI,是钠钾离子浓度测定时所用到的选择性荧光指示剂。这类苯并呋喃间苯二甲酸酯的衍生物以及其具有膜透性的乙酰氧基甲基酯形式(AM 酯)可以在生理条件(含多种其他一价阳离子)下,给予钠钾离子浓度以上时间及空间上准确的变化测量精度。
此外,这类染料的激光光谱可以选择用与Fura-2 类似的滤光器与检测仪。.这些钠钾探针指示剂由荧光团与氮冠醚成环状连接,赋予各自的配位体选择性。在pH7,且Na 或K 离子缺失的情况下,SBFI 和PBFI 的消光系数大约在42,000 cm-1M-1(346 nm)。一旦与离子结合,其激发峰显著收窄,大激发峰向短波段偏移,光能量吸收比值变为340nm/380nm。SBFI 结合Na 离子之后荧光度约增2.5 倍,但发射光谱大值基本不变。pH6.5~7.5,这类荧光素的光谱特性基本维持不变,相比较而言,离子浓度和粘度对其影响更大。 虽然这类离子指示剂有相当的选择性,但对于Na 离子亲和的SBFI 来说K 离子同样有一定的影响,PBFI 也是如此。在K 离子生理浓度下,SBFI 对于Na 的Kd 值为11.3mM,而没有K 离子存在时,则为3.8mM。SBFI 对Na 的选择性比K 要高出18 倍。 同样地,PBFI 对K 离子的解离常数也烈地依赖于Na 的存在。Na 的是否存在,使得PBFI 对于K 离子的Kd 从100mM 到10mM不等。虽然PBFI 对于K 离子的选择性仅仅高出Na 的1.5 倍,但在细胞的生理条件下,通常K 离子的浓度要高于Na 的10 倍以上。所以,在胞内加载探针时,这些探针的Kd 值应与适当的载体做校准。 用无水DMSO 制备SBFI 酯类的储液,浓度为10mM。SBFI AM 的相对分子量分别为1127.由于这类AM 酯形式的探针水溶性比较差,建议溶解时,使用必要的Pluronic F-127.通常可以在进行加载探针到细胞之前,将探针的DMSO 溶液与等体积25%(w/V)的PluronicF-127 混合。探针加载浓度范围:5μM~10μM,孵育时间40 分钟~4 小时。具体的加载条件好能参考相关文献或者实验摸索,因为该探针在不同的细胞内的Kd 值不同。校准细胞内SBFI 的Kd 可以用短抗生素。一般来说,这些指示探针可以用340nm 激发光激发,但在380nm 荧光对于目的离子的浓度尤其敏感。发射峰的检测可以设置在500nm,计算Na+浓度。 |
实验步骤:
(1)实验开始前将RNA提取液于65℃水浴锅中预热,离心管中加入ME(巯基乙醇),(10mL加80ul,50mL中加入300ul)
(2)取约0.8g菌丝体(液体培养获得的菌丝用真空抽滤即可!固体培养就更好说了),在液氮中迅速磨成精细粉末,装入50mL离心管,按1g材料8mL的量加入预热的RNA提取液,颠倒混匀
(3)65℃水浴3-10 min,期间混匀2-3次
(4)加入等体积的酚(注意是酸酚pH4.5)::异戊醇(25:24:1)抽提(10,000rpm,4℃,5 min)
(5)取上清,等体积的:异戊醇(24:1)抽提(10,000rpm,4℃,5 min)
(6)加入1/4V体积10M LiCl溶液,4℃放置6h以上(或过夜)
(7)10,000rpm,4℃离心20min
(8)弃上清,用500ul SSTE溶解沉淀
(9)酚::异戊醇(25:24:1)抽提两次,:异戊醇(24:1)抽提1次(10,000rpm,4℃,5min)
(10)加2V体积的无水乙醇,在-70℃冰箱沉淀30min以上
(11)12,000rpm,4℃离心20 min
(12)弃上清.沉淀用70%酒精漂洗一次,干燥
(13)加200ul的DEPC处理水溶解
(14)用非变性琼脂糖凝胶电泳和紫外分光光度计扫描检测RNA的质量
(在抽提过程中,若蛋白质含量或其它的杂质还较多,可以增加抽提次数)
操作步骤:
1. 匀浆处理:a.组织 将组织在液氮中磨碎,每50-100mg组织加入1ml TRIzol,用匀浆仪进行匀浆处理。样品体积不应超过TRIzol体积10℅。
b.单层培养细胞 直接在培养板中加入TRIzol裂解细胞,每10cm2面积(即3.5cm直径的培养板)加1ml,用移液器吸打几次。TRIzol的用量应根据培养板面积而定,不取决于细胞数。TRIzol加量不足可能导致提取的RNA有DNA污染。
c.细胞悬液 离心收集细胞,每5-10×106动物、植物、酵母细胞或1×107细菌细胞加入1ml TRIzol,反复吸打。加TRIzol之前不要洗涤细胞以免mRNA降解。一些酵母和细菌细胞需用匀浆仪处理。产品仅用于科研
2.将匀浆样品在室温(15-30℃)放置5分钟,使核酸蛋白复合物完全分离。
3.可选步骤:如样品中含有较多蛋白质,脂肪,多糖或胞外物质(肌肉,植物结节部分等)可于2-8℃10000×g离心10分钟,取上清。离心得到的沉淀中包括细胞外膜,多糖,高分子量DNA,上清中含有RNA。处理脂肪组织时,上层有大量油脂应去除。取澄清的匀浆液进行下一步操作。
5. 每使用1ml TRIzol加入0.2ml,剧烈振荡15秒,室温放置3分钟。
6. 2-8℃10000×g离心15分钟。样品分为三层:底层为黄色有机相,上层为无色水相和一个中间层。RNA主要在水相中,水相体积约为所用TRIzol试剂的60℅。
7. 把水相转移到新管中,如要分离DNA和蛋白质可保留有机相,进一步操作见后。用异丙醇沉淀水相中的RNA。每使用1ml TRIzol加入0.5ml异丙醇,室温放置10分钟。
8. 2-8℃10000×g离心10分钟,离心前看不出RNA沉淀,离心后在管侧和管底出现胶状沉淀。移去上清。